Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CLUAP1-202ENST00000571025 5126 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF226-204ENST00000454662 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FANCC-210ENST00000490972 2709 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC9.22□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EPHA5-206ENST00000622150 8421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
VPREB1P12018 SRRT-216ENST00000618262 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms