Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CT47B1P0C2W7 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CT47B1P0C2W7 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms