Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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CLDN9O95484 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
CLDN9O95484 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CLDN9O95484 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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