Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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TRAF6Q9Y4K3 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAF6Q9Y4K3 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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