Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ELOVL4-201ENST00000369816 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MUC20-203ENST00000436408 2463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 XRCC6-201ENST00000359308 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 FAM193A-201ENST00000324666 4846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM5Q9C035 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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