Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

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Length 410 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TRIO-202ENST00000344204 11100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CNPPD1Q9BV87 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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