Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 FAHD2A-204ENST00000447036 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PNLIP-201ENST00000369221 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 HNRNPA1P59-201ENST00000430583 918 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CFL1P1-204ENST00000456375 424 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AP002495.1-205ENST00000529513 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MIR5193-201ENST00000584510 109 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC002511.3-201ENST00000638098 420 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 IGFL1-201ENST00000437936 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC098820.2-201ENST00000457694 666 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLC26A8-202ENST00000394602 3144 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC00544-201ENST00000400540 1031 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC009517.1-201ENST00000454750 570 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC116914.2-201ENST00000571741 291 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TUBB4A-207ENST00000596926 548 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SHOC2-202ENST00000369452 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC02449-201ENST00000304751 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SNHG14-201ENST00000414175 610 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 CDHR4-205ENST00000487256 1017 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 FDPS-220ENST00000611010 1196 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SNHG5-213ENST00000622963 753 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC005906.2-208ENST00000638655 1286 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
LYSTQ99698 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms