Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB13-203ENST00000537753 912 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms