Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SCG3Q8WXD2 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SCG3Q8WXD2 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SCG3Q8WXD2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SCG3Q8WXD2 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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SCG3Q8WXD2 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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SCG3Q8WXD2 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SCG3Q8WXD2 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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