Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC104212.2-201ENST00000478813 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MKRN3-202ENST00000564592 629 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GSTT2-202ENST00000621118 1112 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ATP6V1C1-205ENST00000521514 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC073896.4-201ENST00000553176 403 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KLHDC9Q8NEP7 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms