Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC174Q6PII3 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms