Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PJA1-203ENST00000374583 2692 ntAPPRIS P4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RBM47-201ENST00000295971 4056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ATG4C-201ENST00000317868 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AC004846.1-201ENST00000554614 3050 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
KLHL22Q53GT1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms