Protein–RNA interactions for Protein: Q53GS9

USP39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 565 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP39Q53GS9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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USP39Q53GS9 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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USP39Q53GS9 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP39Q53GS9 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP39Q53GS9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP39Q53GS9 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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USP39Q53GS9 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
USP39Q53GS9 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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