Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCDC96Q2M329 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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