Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GABPAQ06546 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms