Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATP2C1P98194 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms