Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SPG20-AS1-203ENST00000493739 566 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC023509.3-202ENST00000591834 1609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TEX38-201ENST00000334122 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GSG1L2-201ENST00000399363 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC245128.1-201ENST00000400864 1294 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TCEA3-204ENST00000461794 713 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC009041.1-202ENST00000599946 987 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PACRG-AS3-204ENST00000620150 567 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 LINC01833-204ENST00000444871 581 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PTPN20-229ENST00000513756 640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CD276-217ENST00000564751 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 DERL2-206ENST00000572834 589 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SDHD-214ENST00000614349 516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TUBD1-202ENST00000340993 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RN7SL677P-201ENST00000466970 319 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC068152.1-205ENST00000575173 1081 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CDK7-201ENST00000256443 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC012358.2-201ENST00000430010 1434 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GNG4-201ENST00000366597 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SLC36A1-211ENST00000616007 1389 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RPSAP61-201ENST00000412542 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 CIDEC-204ENST00000430427 877 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 RN7SL789P-201ENST00000478944 293 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 MIR4640-201ENST00000581824 90 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 AC127002.1-201ENST00000619123 455 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 IGHE-202ENST00000641420 1485 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SMARCA2P51531 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms