Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CARS-214ENST00000529772 2637 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CASP1P29466 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms