Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 DAP3-201ENST00000343043 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TTTY18-201ENST00000438677 221 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AL109924.1-201ENST00000444586 914 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC007610.1-201ENST00000568130 498 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 HMOX2-213ENST00000575120 1027 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AC087072.1-201ENST00000603727 421 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTGFP29279 LINC00967-203ENST00000518035 1502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTGFP29279 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTGFP29279 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTGFP29279 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTGFP29279 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CTGFP29279 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 DPH2-202ENST00000396758 1738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 MRPS28-201ENST00000276585 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SAP18P2-201ENST00000434334 459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AL161727.1-201ENST00000457409 530 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TSTD1-206ENST00000466967 477 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SRD5A3-AS1-203ENST00000591915 709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC003070.1-201ENST00000592389 457 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 AC137723.2-201ENST00000623540 398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTGFP29279 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTGFP29279 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms