Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LINC00388-201ENST00000412714 663 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC116025.1-201ENST00000575404 415 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLD1P28340 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 WFDC2-203ENST00000342873 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 APOBEC3B-204ENST00000407298 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 IDH3A-213ENST00000559205 566 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC007728.1-202ENST00000564510 787 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ELP4-223ENST00000640342 1392 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NR2C2AP-201ENST00000331552 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 NR2C2AP-202ENST00000420605 859 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
POLD1P28340 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms