Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
IL3RAP26951 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 USP47-202ENST00000339865 7775 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 BIVM-ERCC5-205ENST00000639435 5632 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
IL3RAP26951 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms