Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 AMIGO3-201ENST00000320431 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ZNF275-201ENST00000370249 5920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCNA2P20248 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms