Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TRIM21P19474 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms