Protein–RNA interactions for Protein: P17480

UBTF, Nucleolar transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFP17480 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBTFP17480 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
UBTFP17480 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBTFP17480 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms