Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
EPCAMP16422 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EPCAMP16422 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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