Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 FAM133B-204ENST00000445716 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL121753.2-201ENST00000624581 1461 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 EDDM3B-201ENST00000326783 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 PDE4DIP-202ENST00000369347 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LINC01502-203ENST00000447907 880 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL353653.1-201ENST00000452336 638 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 GIMAP6-202ENST00000493969 876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 BPIFB1-201ENST00000253354 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 EDEM2-201ENST00000374491 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 GAST-201ENST00000329402 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AP001092.1-201ENST00000433606 469 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC139493.2-202ENST00000510155 544 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FAM90A28P-201ENST00000596881 489 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL513478.2-202ENST00000621949 835 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 PLA2G2E-201ENST00000375116 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CDKN2A-AS1-201ENST00000441769 823 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC108724.1-201ENST00000481669 352 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AKIP1-203ENST00000309377 1327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 AL157832.2-205ENST00000597245 1649 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 HIST2H2BE-201ENST00000369155 2194 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TOP2AP11388 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms