Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 CHTF18-201ENST00000262315 3090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
DENRO43583 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 FMO1-203ENST00000402921 2003 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 RBM39-243ENST00000528062 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 TMEM134-201ENST00000308022 3534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SMG8-202ENST00000543872 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 NAA60-214ENST00000572584 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 ARHGEF9-203ENST00000374872 2364 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SMIM27-203ENST00000451672 2382 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 KLF4-206ENST00000610832 1956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CEACAM20-201ENST00000611497 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 GRIK5-202ENST00000301218 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SMIM21-202ENST00000579022 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 CSNK1G1-209ENST00000634811 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
DENRO43583 SCP2-203ENST00000371514 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 DIDO1-202ENST00000354665 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 KIAA1958-202ENST00000374244 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 ITIH5-201ENST00000397145 3132 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 KIAA1324-210ENST00000529753 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
DENRO43583 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms