Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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HOXA3O43365 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
HOXA3O43365 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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