Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC103702.2-203ENST00000425510 379 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC023968.2-201ENST00000560593 1049 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
C4orf47A7E2U8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms