Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SIN3AQ96ST3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms