Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LMO3Q8TAP4 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 APOD-201ENST00000343267 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL589935.1-203ENST00000412751 465 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LMO3Q8TAP4 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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