Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHOT2Q8IXI1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RHOT2Q8IXI1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms