Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 GPR107-208ENST00000610997 2813 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CCDC80Q76M96 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms