Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FOXD4L6Q3SYB3 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TNFRSF8-203ENST00000417814 3593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FOXD4L6Q3SYB3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms