Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXP7

KIAA1644, Uncharacterized protein KIAA1644, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1644Q3SXP7 WDR62-203ENST00000401500 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ABCC3-201ENST00000285238 5716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 MICAL2-201ENST00000256194 3906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CNTROB-203ENST00000565740 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 PI4KB-201ENST00000368872 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 NLRP7-206ENST00000588756 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 TMEM94-201ENST00000314256 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 WIPF3-201ENST00000242140 4184 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 BCL2L11-217ENST00000610735 5120 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 IL2RG-203ENST00000374202 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 HMGCS1-201ENST00000325110 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 SMG7-214ENST00000508461 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ALDH4A1-202ENST00000375341 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 SLC1A2-208ENST00000606205 1890 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ALDH1L1-202ENST00000393431 2797 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 STK40-203ENST00000373130 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 IRAK1BP1-201ENST00000369940 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CA10-202ENST00000442502 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CPNE4-201ENST00000429747 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ZIK1-202ENST00000536878 4144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 HTR2C-203ENST00000371951 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 KIF9-207ENST00000444589 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 KIF13A-201ENST00000259711 5941 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CEP83-208ENST00000547575 3122 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ZNF667-201ENST00000292069 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 AOC2-202ENST00000452774 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 TRIM37-203ENST00000393066 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CU639417.6-202ENST00000624872 3241 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 NXPE3-201ENST00000273347 3941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ZFYVE19-209ENST00000564258 2059 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 GLUL-204ENST00000417584 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 CSF3R-201ENST00000331941 2375 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 LYRM9-202ENST00000379103 1685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 GRIA4-202ENST00000393125 2994 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 FBXW8-202ENST00000455858 4648 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 NLRP2-208ENST00000448584 3573 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
KIAA1644Q3SXP7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms