Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01119-202ENST00000468141 2157 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL365181.2-201ENST00000606343 3222 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MYL9-201ENST00000279022 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ASB2-203ENST00000555019 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC10A1-201ENST00000216540 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 OS9-202ENST00000315970 2691 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KLK2-203ENST00000391810 2674 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02052-202ENST00000427914 2285 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MATN2-211ENST00000521689 3554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TNKS-213ENST00000522110 2900 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BHMT-201ENST00000274353 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZMIZ2-215ENST00000615423 2772 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SPRY2-202ENST00000377104 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL031687.1-201ENST00000450586 2137 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AGAP12P-202ENST00000603888 2141 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RHOH-219ENST00000614836 2114 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RASAL1-203ENST00000446861 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AL645608.3-201ENST00000448179 3043 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RHD-210ENST00000622561 3007 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FP565260.1-201ENST00000617716 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF552-201ENST00000391701 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEMA3F-206ENST00000434342 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SEPT4-223ENST00000583114 1709 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 AC068299.1-201ENST00000624716 1749 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS9-203ENST00000395473 3114 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CTSE-201ENST00000358184 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF277-203ENST00000421043 2218 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ANAPC7-201ENST00000450008 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ANKUB1-202ENST00000462519 2222 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 ALDH3B2-204ENST00000530069 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 BOLL-201ENST00000282278 2742 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
KRTAP21-1Q3LI58 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms