Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GPR132-202ENST00000392585 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PCDHGA5-201ENST00000518069 4602 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TROVE2-208ENST00000432079 7848 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
IMPG1Q17R60 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms