Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RBMS3-210ENST00000456853 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GLDC-216ENST00000639639 1559 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL591499.1-201ENST00000307155 1153 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MESTP4-201ENST00000412333 1204 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC017081.1-201ENST00000420063 823 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC073465.1-201ENST00000456671 464 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 EIF5A-207ENST00000572815 811 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RPL26-209ENST00000584164 873 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC009061.2-204ENST00000602476 524 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SRP54-AS1-204ENST00000556705 580 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RACK1-227ENST00000512805 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 MRPL45P2-201ENST00000425159 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC006001.2-202ENST00000439360 508 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRXP46100 CETN3-205ENST00000522842 664 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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