Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ACADSBP45954 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms