Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 TMOD1-201ENST00000259365 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PRAMEF25-201ENST00000614839 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PRAMEF26-201ENST00000624207 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CHGB-201ENST00000378961 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
CTRLP40313 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 C9orf170-201ENST00000623052 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AC068580.3-201ENST00000449248 2015 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PGM3-201ENST00000283977 2219 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 NLRX1-214ENST00000525863 2850 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PPP1R11-205ENST00000376772 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ILF3-219ENST00000590261 3219 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PLAT-202ENST00000352041 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CTRLP40313 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 FAM53B-203ENST00000392754 3557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 KLHL12-203ENST00000367261 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 PM20D1-201ENST00000367136 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CTRLP40313 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CTRLP40313 APBB1-223ENST00000618005 2107 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CTRLP40313 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CTRLP40313 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CTRLP40313 WDR66-202ENST00000397454 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CTRLP40313 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CTRLP40313 GRK7-201ENST00000264952 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms