Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FBXL18-201ENST00000382368 3498 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GGCXP38435 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GGCXP38435 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms