Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SLC8A1P32418 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SLC8A1P32418 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms