Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GTF2E1P29083 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC145285.5-201ENST00000562217 361 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF2E1P29083 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms