Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RBM4B-202ENST00000524637 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ARF4P18085 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms