Protein–RNA interactions for Protein: O15554

KCNN4, Intermediate conductance calcium-activated potassium channel protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNN4O15554 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCNN4O15554 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCNN4O15554 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms