Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RALGAPB-203ENST00000397042 8652 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 POTEI-201ENST00000451531 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HELTA6NFD8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms