Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFIP11Q9UBB9 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms