Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CHPF2Q9P2E5 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 LINC00244-201ENST00000625073 613 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CHPF2Q9P2E5 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms