Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BBS2Q9BXC9 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BBS2Q9BXC9 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms