Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PPM1N-203ENST00000396737 872 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 VEGFA-219ENST00000518824 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 FAM153C-201ENST00000398106 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FYCO1Q9BQS8 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms